伊拉克利翁(Heraklion)（希臘語：Ηρ?κλειο）是希臘位于克里特島上的最大的城市，同時也是克里特大區和伊拉克利翁州的首府，人口137,711（2001年）。
伊拉克利翁是彌諾斯文明時期克里特島最大的人口中心，雅典第五大城市，也是克里特島的首府。據說古希臘神話中米諾斯王的王宮，米諾斯迷宮就建在這里。由阿瑟·埃文斯發現并發掘的克諾索斯宮殿遺址就位于附近。由此可以推斷大約在公元前2000年左右這里應該有港口存在，但這一推斷并未得到考古證據證明。
埃及伊拉克利翁古城擁有著美麗而神秘的傳說，它曾是一個繁「榮的海港城市，在1500年前沉入海底，希臘歷史學家希羅多德曾在公元前5世紀贊美伊拉克利翁是一座宏偉壯觀的城市。
希羅多德還講述了關于絕世美女海倫的故事，她是當時世界上最美麗的女人，曾在特洛伊戰爭爆發之前與愛人帕里斯旅行至伊拉克利翁。
但是直到2001年仍未發現任何考古證據證實伊拉克利翁沉沒的地點，最終法國海洋考古學家弗蘭克-戈迪奧(Franck Goddio)偶然發現一些遺跡，從而證實這是21世紀最偉大的一項考古發現。
后期戈迪奧與牛津海洋考古學研究中心和埃及文物部發現大量的文物，最初階段考古學家們面臨一個棘手任務——如何將海底大量石塊碎片重新組裝起來。
他們陸續發現一些巨大雕像，其中包括：埃及女神伊希斯、哈皮神、以及一具未辨識的埃及法老雕像，它們保存狀況非常完好，是由泥漿完全包裹起來。
伊拉克利翁古城的重要性被進一步證實——發現64艘船，這是在一個地點發現最多數量的古代船只，同時，還發現700多個錨。其它的一些發現展現了伊拉克利翁古城對于古代經濟的重要性，發現大量的金幣、鉛、銅和來自雅典的石頭砝碼，證實伊拉克利翁曾是地中海最重要的貿易港口。
現代的伊拉克利翁于824年由撒拉遜人建立，命名為andaq.他們在城市周邊挖了護城河并允許海盜將其作為避風港。
961年，拜占庭帝國攻占伊拉克利翁，大肆屠殺撒拉遜人，將城市付之一炬并在其重建後對其進行了長達243年的控制。
1203年，第四次東征十字軍扶持已被廢黜的拜占庭皇帝伊薩克二世重登皇位。作為此次政治交易的一部分，次年，協助過十字軍的威尼斯共和國控制了伊拉克利翁。威尼斯人改進加固了城市防御工事并將其更名為意大利語「甘地亞（Candia）」，至今仍有人用此來稱呼克里特島。
1647年，奧斯曼帝國對伊拉克利翁進行了長達22年的圍攻，血腥的戰爭使30,000克里特島人和120,000土耳其人死亡。威尼斯人最終於1669年投降，奧斯曼帝國占領城市并其及整個克里特島更名為「Kania」。後來，伊拉克利翁港逐漸淤塞，奧斯曼人將大部分生意都轉到了島西部的哈尼亞。
1898年，奧斯曼人撤離，伊拉克利翁獲得獨立。1913年，城市成為希臘王國的成員并更名為現名，意為赫拉克勒斯之城（City of Heracles）。