一般供貨商先提早預定貨品送達京東庫房的時刻，送達后京東會對產品進行抽檢。在庫房的進口京東設立了快檢實驗室，以國標及以上規范抽檢生鮮產品的質量，例如蔬果的農藥殘留，畜禽、水產品的獸藥殘留等，需求進行雜亂的微生物檢測的則需求經過第三方組織，檢測合格之后放可入庫上架，依據不同品類放置于不同的溫區，進入深冷區域需求穿戴厚重的防寒服。爆款放置于貨架的底層，以進步分揀功率。

京東接到顧客訂單后，進行分揀打包出庫，每個訂單獨自打包，一般情況下運用的是可回收的保溫箱（塑料+隔熱箔制成，四周還留有夾層，可放置冰板。冰板分兩種，白色用于冷藏保鮮品，藍色用于冷凍品），應急情況下和部分偏遠地區考慮到回收本錢等問題則運用泡沫箱+干冰等方法。然后由冷鏈車運送至各個配送站點。京東生鮮的最終一公里配送人員便是京東商城的配送人員，這也是京東生鮮在物流本錢方面的優勢。

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